Die Meeresbiom ist das letzte der auf Wasser spezialisierten Biome in PokéRogue. Die Pokémon, die hier auftauchen, sind von hoher Seltenheit, einschließlich einiger seltener und äußerst seltener Wasser-Pokémon. Dazu gehören Lapras, Piplup und Popplio. Wenn du ein höheres Level erreichst, werden auch die Entwicklungsformen dieser Pokémon erscheinen. Was das Wetter angeht, so besteht im Meeresbiom eine Chance von 20%, dass tagsüber kein Wetter herrscht, und eine Chance von 80%, dass es regnet. Unterschiedliches Wetter beeinflusst die Wahrscheinlichkeit, dass bestimmte Pokémon auftauchen. Marlon, der Anführer des Fitnessstudios, setzt Wasser-Pokémon ein, und wenn du ihn erfolgreich besiegst, erhältst du große Belohnungen. Wie bei den anderen BiomeIm klassischen Modus und im täglichen Lauf wechseln die Biome alle 10 Wellen. Im Endlosmodus hingegen wechselt das Biome-System zufällig zwischen Welle 1 und 4.