Fin del bioma es el último sistema de biomas en PokéRoguedonde los jugadores se enfrentarán al desafío definitivo del juego. En esta fase, los jugadores se enfrentarán a las oleadas 191 a 200, en cada una de las cuales aparecerán Pokémon únicos. Si el jugador ha eclosionado previamente uno de estos Pokémon, podrá intentar capturar un segundo con una Pokeball. De lo contrario, estos Pokémon no podrán ser capturados. En la oleada 200, los jugadores serán recibidos por Eternatus, el jefe final del Modo Clásico. Eternatus tiene un poderoso conjunto de habilidades, y cuando su valor de vida desciende hasta el último segmento, se transforma en forma Eternamax. Biome End no es solo una gran prueba de estrategia y habilidad, sino también una desafiante aventura.