En Bioma marino es el último de los biomas especializados en el agua en PokéRogue. Los Pokémon que aparecen aquí son de gran rareza, incluidos algunos Pokémon de agua raros y superraros. Entre ellos están Lapras, Piplup y Popplio. A medida que subas de nivel, también aparecerán las formas evolucionadas de estos Pokémon. En cuanto al clima, el Bioma Marino tiene una probabilidad de 20% de que no haga mal tiempo durante el día y una probabilidad de 80% de que llueva. Las diferentes condiciones meteorológicas afectan a la probabilidad de que aparezcan ciertos Pokémon. Marlon, el Líder de Gimnasio, usa Pokémon de Agua, y derrotarlo con éxito te reportará grandes recompensas. Al igual que con los otros biomasEn el Modo Clásico y en la Carrera Diaria, los biomas cambian cada 10 oleadas. En cambio, en el modo Endless, el sistema de biomas cambiará aleatoriamente entre las oleadas 1 y 4.