Biome du Dojo est un biome unique et difficile dans le PokéRogue qui se concentre sur les Pokémon de type combat. Dans ce biome, les joueurs auront l'opportunité de rencontrer une grande variété de Pokémon, allant des communs Mankey et Meditite aux puissants Pokémon tels que les rares Lucario et Terrakion. De plus, le Biome Dojo contient de puissants Boss Pokémon que les joueurs devront préparer avec soin pour relever les défis. De plus, les joueurs peuvent affronter différents dresseurs, y compris les chefs de gymnase habituels tels que Brawly et Maylene, dans des batailles intenses en utilisant des Pokémon spécifiques. En Mode Classique et en Course Quotidienne, le biomes changent toutes les 10 vagues, tandis qu'en mode sans fin, les biomes changent aléatoirement entre les vagues 1 et 4.