Biome du cimetière est un biome mystérieux et sinistre dans le PokéRoguequi met en scène principalement des Pokémon de type fantôme. Au fur et à mesure que le joueur monte en niveau, des formes évoluées de certains Pokémon, comme Haunter et Dusclops, peuvent apparaître. Les conditions météorologiques dans le Biome du Cimetière sont variables et ne sont généralement pas 75% du temps, mais il y a 25% une chance de jours brumeux, ce qui peut affecter la précision des combats. Les chefs de Gym de ce biome sont Allister, Morty et Ryme, dont le portefeuille de Pokémon est dominé par les types Fantômes. En mode classique et en course quotidienne, le biome changera toutes les 10 vagues, tandis qu'en mode sans fin, le biome changera aléatoirement entre les vagues 1 et 4.