Bioma do Dojo é um bioma único e desafiante na PokéRogue que se centra em Pokémon do tipo luta. Neste bioma, os jogadores terão a oportunidade de encontrar uma grande variedade de Pokémon, desde os comuns Mankey e Meditite até Pokémon poderosos como os raros Lucario e Terrakion. Além disso, o Dojo Biome contém alguns poderosos Boss Pokémon que os jogadores terão de preparar cuidadosamente para enfrentar os desafios. Além disso, os jogadores podem lutar contra diferentes treinadores, incluindo líderes de ginásio regulares como Brawly e Maylene, em batalhas intensas utilizando Pokémon específicos. No Classic Mode e no Daily Run, o biomas mudam a cada 10 vagas, enquanto no modo Infinito, os biomas mudam aleatoriamente entre as vagas 1 e 4.