Fim do bioma é o sistema de bioma final em PokéRogue, onde os jogadores enfrentarão o derradeiro desafio do jogo. Nesta fase, os jogadores enfrentarão as ondas 191 a 200, com Pokémon únicos a aparecerem em cada onda. Se o jogador já tiver chocado um destes Pokémon, pode tentar capturar um segundo Pokémon com uma Pokebola. Caso contrário, estes Pokémon não serão capturados. Na onda 200, os jogadores serão recebidos por Eternatus, o boss final do Classic Mode. Eternatus tem um conjunto de habilidades poderoso e, quando o seu valor de vida desce até ao último segmento, transforma-se na forma de Eternamax. Biome End não é apenas um grande teste de estratégia e habilidade, mas também uma aventura desafiadora.