Bioma da fábrica é um bioma único em PokéRogue a que os jogadores podem aceder aleatoriamente através da Power Plant. Os Pokémon do tipo Aço encontram-se predominantemente neste bioma, e os jogadores terão a oportunidade de apanhar Pokémon comuns como Machop, Magnemite e Voltorb, bem como Pokémon raros como Metagross e Genesect. O Factory Biome também inclui líderes de ginásio fixos, como Byron e Jasmine, que proporcionam uma experiência de batalha desafiante e enriquecedora. À medida que os jogadores sobem de nível, os Pokémon que aparecem no biomas podem estar nas suas formas evoluídas, aumentando a diversão e a variedade da exploração. No Modo Clássico e na Corrida Diária, os biomas mudam a cada 10 ondas, enquanto no Modo Infinito, esta mudança ocorre aleatoriamente entre as ondas 1 e 4.