Bioma do pântano é um bioma húmido e misterioso em PokéRogue, onde os jogadores encontrarão uma abundância de Pokémon de Água e Veneno. Isto deve-se principalmente ao facto de as condições meteorológicas aqui serem normalmente escuras e húmidas, proporcionando uma boa oportunidade para o aparecimento de Pokémon do tipo Água. Além disso, os jogadores também podem encontrar Pokémon raros, como o Totodile e o Mudkip, embora estes sejam menos prováveis de aparecer. A Janine e a Roxie são as Gym Leaders deste bioma e os jogadores serão recompensados se as derrotarem. Por último, tal como acontece com os outros biomas, o Classic Mode e o Daily Run, biomas mudará a cada 10 ondas. O sistema de biomas do modo infinito muda aleatoriamente nas ondas 1-4.